DNA関連

エクソン領域のみを回収してシーケンスを行い、検体間での変異（SNPs, short insertion／deletion など） を解析する手法です。 エクソン領域に限定しているため取得に必要なデータ…

デジタルPCRは、微細なウェルに対してサンプル中のDNAやcDNAを分子レベルの極微量で分配し、全ウェル同時並行にエンドポイントPCRを行うことで、個々の分子の数を絶対定量する手法です。 非常に高い精…

キャンサーパネルを使用してがん遺伝子または腫瘍抑制遺伝子の全エキソンまたはホットスポット変異をHigh depthでシーケンシングを行えます。 FFPEのDNAからも解析可能です。 がんの遺伝子は変異…

GBS (Genotyping by sequencing)解析とは、次世代シーケンスを用いてジェノタイピングを行う手法です。 制限酵素で消化したゲノム断片の切断サイト付近のシーケンスを行い、配列中の…

メタゲノム解析は、環境サンプル中に存在する微生物のゲノムＤＮＡを抽出・回収し、その全ゲノムＤＮＡを網羅的（ショットガン）にシーケンスする手法です。 従来の方法では難しかった難培養菌のゲノム情報の取得や…

細菌（16S）や真菌（18S）および ITS （internal transcribed spacer） 各領域を指標として増幅した PCR産物（アンプリコン）を対象に、次世代シーケンサーを用いて大量…

転写調節因子やヒストン修飾研究でオープンクロマチン領域を網羅的に解析する手法です。 Chip-Seqと異なり目的とする抗体のない生物種でも解析することができます。 また、免疫沈降が不要のためChip-…

転写調節因子やヒストン修飾研究で利用されるクロマチン免疫沈降（ChIP : Chromatin Immunoprecipitation） サンプルを網羅的に解析する手法です。 ChIPで得られたＤＮＡ…

遺伝子のプロモーター付近にはCpGアイランドと呼ばれるCpG配列が高頻度に存在しており、シトシン（C）のメチル化の有無による転写制御が行われています。 そこで、主にどのようなCpGアイランドがメチル化…

次世代シーケンスを用いることにより、染色体の3次元空間内の立体配座を解明する手法です。 生体内でゲノムがどのような立体構造を持ち、離れた構造同士が３次元的にどのような距離を取るかを網羅的に見ることで、…