3次元ゲノム構築(Hi-C解析・Omni-C)  

次世代シーケンスを用いることにより、染色体の3次元空間内の立体配座を解明する手法です。
生体内でゲノムがどのような立体構造を持ち、離れた構造同士が3次元的にどのような距離を取るかを網羅的に見ることで、構造と機能の関係を明らかにすることを目的とします。
ほ乳類細胞、組織、血液、昆虫、植物、海洋動物など幅広いサンプルで実績があり、PacBioのロングリードシーケンス解析を組み合わせることにより、近接ライゲーションと染色体レベルのゲノムアセンブリを実施します。

特徴
  • 多様な動植物ゲノムにおいて、染色体スケールのアセンブリ が可能
  • 所有しているアセンブリデータを用いて、Hi-C解析/Omni-C解析を 行うことにより、新しいアセンブリデータを構築することが可能
  • 混合サンプルから特定の種ごとのアセンブリが可能
  • 自身でキットを用いてサンプル調製を行い、シーケンスから依頼する ことも可能
価格帯
  • 約250万円~/サンプル
受託メーカー選びのポイント
  • 生物種のゲノムサイズを伝え対応可能かどうか確認
  • アセンブリ以外の追加解析が可能かどうか確認


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研究現場のお困りごと

  • こんなとき、どうしたら良いのだろう?
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