RNAシーケンス RNA関連 small RNA シーケンス miRNA(microRNA) を代表とした small RNA の発現変動解析です。 small RNA の両端にアダプターを付加し、次世代シーケンサーでシーケンスすることで、small RNA の…
RNAシーケンス RNA関連 mRNA シーケンス 次世代シーケンサーを用いたmRNA シーケンスは、サンプル中のmRNAを網羅的にシーケンスすることで発現定量値を算出および変動比較するだけでなく、新規転写産物の探索や、選択的スプライシングや融合遺伝子…
PickUp RNAシーケンス RNA関連 Iso-Seq(ロングリード RNAシーケンス) 遺伝子発現の変化を調べることで生命現象を理解しようとする試みにおいて、遺伝子全体の発現量だけでなく、選択的スプライシングにより現象が制御されていることがわかってきました。 Iso-Seqとは、アイソフ…
PickUp RNAシーケンス RNA関連 ナノポアシーケンス (ロングリードシーケンス) Oxford Nanopore Technologies社が提供するロングリードシーケンサーを用いてシーケンスを行うサービスです。 ポリマー製の膜に埋め込まれたタンパク質のナノポアをDNA分子やRNA…
PickUp RNAシーケンス RNA関連 シングルセル RNA シーケンス (シングルセル トランスクリプトーム解析) 近年の急速な分析技術の進歩により、細胞や分子の性質を、集団の平均値としてではなく、一つひとつの細胞や分子の個性を維持したまま解析することが可能になりました。 シングルセルRNAシーケンスでは、個々の細…