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オプティカルゲノムマッピング
Saphyr Systemによるオプティカルゲノムマッピング解析を行います。
従来の技術では困難であった1 Mbレベルの長鎖DNAフラグメントの解析を実現しており、 ゲノム中に存在する挿入・欠失・転座・逆位・重複といった大きな構造変化を検出できます。
さらに次世代シーケンサー(NGS)データと組み合わせるHybrid Scaffoldingによるゲノムアッセンブリに対応し、NGSデータのアッセンブリを染色体レベルまで改善した例もあります。
オプティカルゲノムマッピングにより、配列レベルからゲノム構造・染色体レベルまでゲノム解析の幅が広がります。
- 400kbp程度のDNAをSaphyrシステムで電気泳動し、得られた像から専用解析ソフトにより、構造多型を含む高精度な ゲノムマップを作成可能
- 1Mbpを超える長鎖ゲノムDNA断片を増幅なしで直接的に解析 あらゆる生物種に対応可能（ただし、筋組織は苦手）
- 約60万円～／サンプ
- 受託プロバイダーは現在1社 のみのため、選択肢はまだあり ません。まずはお気軽にお問い 合わせください。
saphyr（サファイア）
