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HiSeq/NovaSeq を用いたリシーケンス(ゲノム変異解析)
ゲノムワイドにリードを取得(数十Gb以上)し、得られたリードをリファレンス配列に対してマッピングすることで、ゲノム全体の配列情報を取得します。
さらに、複数サンプル間での配列を比較することで、サンプル特異的な変異(SNPs, CNV:コピー数多型, SV:構造多型 など)を見つけることが可能です。
需要の増加やシーケンサーメーカーの戦略の影響を受けて、特に低価格化が進んでいる受託サービスです。
- リファレンスを用いてゲノムワイドな配列を構築
- 配列間の変異や一次構造を解析・特定することが主目的
- 哺乳類などの高等生物でも、10万円代(解析不含)で実施可能。
- 埋めきれない「配列の隙間(ギャップ)」が出来てしまう。
- 約10万円〜/サンプル
- (Ex. ヒトゲノム、解析込みの場合)
- 技術差が生まれにくいサービスのため、1サンプル当りの単価が最注目ポイント
- 設定価格にデータ解析は含まれているか
- 分析は国内? 海外?
Sequel II
PromethION