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miRNA マイクロアレイ
miRNA(microRNA)を検出するプローブを搭載したアレイスライドを用いることで、既知のmiRNAに対して網羅的な発現変動解析を実施するサービスです。
上記の遺伝子発現解析(mRNA マイクロアレイ)と同様、Agilent Technology社とAffimetrix社 が世界的なシェアを有していますが、国内においては日本企業である東レが提供する 「3D-Gene」 も広く利用されています。
サンプル(特に由来の生体試料)によって各プラットフォームに得手不得手が存在し、注意が必要です。
- 既知miRNAについて、サンプル間の発現変動を網羅的に解析
- サンプルによってプラットフォームを選択する必要あり
- small RNAシーケンスに比べて、納期が短い (3週間程度~)
- 約12万円~/サンプル
- (多検体値引きあり)
- プラットフォームによっては提供していないメーカーあり
- 基本的にはmRNAと同様、価格と対応のどちらを重視するか
ヒートマップ/ クラスタリング解析
Scatter plot
KEGG Pathway